情報不足で何とも…、中学の友達はその方だけ呼ぶんですか？仲良しなら相談内容そのままをお友達と話し合えばいいのに、とも思います。

『来てもらえると嬉しいから、御祝儀は包んで来なくていいよ。手ぶらで来て！式場の受付で先に私へ渡してありますって言っちゃっていい。』と伝えては？
それでもメンツで当日包んで来たら後日『お互い様だから、うちらの仲では無しにしよーよ！みんなには内緒でね！』と、現金だと突っ返すみたいになるから、あえて全額をよくいく店の商品券にしてお祝い返しにするといい。
常識とはまた違ったやりかただけど、友達ならいいんじゃないかな。旦那さんの親には返金は知られないようにね。

ちなみに常識的には、二次会に呼ばれたなら二次会に呼べば十分だし、自分たちの都合でアタフタした挙式だったとしても、後から結婚する人に呼ばれたら、もらってなかろうが御祝儀は包むものです。

ご結婚おめでとうございます。お幸せに！